Skladište je moguće izbrisati samo u slučaju da nikada nije bilo upotrebljeno na bilo kom od dokumenata (otpremnici, primci, međuskladišnici, računu, itd). U protivnom, skladište je potrebno deaktivirati (pogledajte sliku ispod). U tom slučaju, skladište više nije moguće odabrati na novim dokumentima. Na starim će i dalje biti prikazano.
Skladište sa zalihama je također moguće deaktivirati. U tom slučaju će se skladište i zalihe i dalje prikazivati na izvještajima, (npr. na Ispisu zaliha za Skladište) ili u inventurama. Ako želite isprazniti zalihe skladišta, možete kreirati međuskladišnicu ili djelomičnu inventuru.